Dos años duró Atlético Choloma en Primera División al consumarse el descenso con su empate ante Marathón el sábado anterior en San Pedro Sula.
Los cholomeños ascendieron el 18 de junio de 2011 al vencer 1-0 al Parrillas One con gol de Luciano Valerio.
Debutó en Liga Nacional perdiendo 2-0 frente a Olimpia en el Estadio Nacional en el arranque del Apertura 2011.
Su primer gol en Liga Nacional lo marcó Franco Güity en el empate 1-1 ante Motagua una semana más tarde, y su primer triunfo lo logró ante Platense en la fecha 3, jugando en el estadio Rubén Deras, de Choloma.
En su corto paso por Liga Nacional jugó el repechaje del Clausura 2011 siendo eliminado por Real España y llegó hasta las semifinales del Apertura 2012, dejando fuera a Marathón y cediendo en la penúltima instancia del torneo contra Olimpia.
Los cholomeños jugaron 78 partidos en Liga Nacional, con 19 ganes, 33 empates y 26 derrotas, 95 goles a su favor y 108 en contra, para un total de 90 puntos sobre 234 en disputa, con un rendimiento de 38% en su paso por Liga Nacional.
En el Apertura 2012 obtuvo su mayor goleada en su paso por Liga Nacional al derrotar 5-1 a Platense en el estadio Rubén Guifarro con tres goles de Aldo Oviedo y anotaciones sencillas de Jorge Campbell y óscar Torlacoff.
Su peor derrota en Liga Nacional se la propinó Victoria, que lo goleó 4-0 en el Apertura 2011 jugando en el estadio Ceibeño.
Solo dos entrenadores tuvo en su paso por Liga Nacional, Rubén Guifarro y Edwin Pavón, quien cosechó su tercer descenso tras bajar con Atlético Olanchano y Real Juventud.
Su mejor goleador en Liga Nacional y todo un ejemplo a su edad fue el uruguayo óscar Torlacoff, autor de 23 goles, después vienen Franco Güity y Aldo Oviedo, con nueve, y Osman Hernández, con ocho.
Los descendidos en Honduras
Año Descendido
1965
No hubo
1966
Troya
1967
San Pedro
1968
Atlético Español
1969
Progreso
1970
Victoria
1971
Lempira
1972
No hubo
1973
Troya
1974
Atlético Indio
1975
Atlántida
1976
Campamento
1977
Federal
1978
Tiburones
1979
Atlético Portuario
1980
No hubo
1981
Platense y Universidad
1982
Independiente
1983
Dandy
1984
Sula
1985
Universidad
1986
Tela Timsa
1987
EACI
1988
Universidad
1989
Curacao
1990
Sula
1991
Atlético Indio
1992
Súper Estrella
1993
Petrotela
1994
Deportes Progreseños
1995
Broncos
1996
Independiente
1997
Independiente y Palestino
1998
Real Maya
1999
Federal
2000
Broncos
2001
Deportes Savio
2002
Victoria
2003
Real Patepluma
2004
Atlético Olanchano
2005
Hispano
2006
Universidad
2007
Atlético Olanchano
2008
Real Juventud
2009
Real Juventud
2010
Hispano
2011
Platense
2012
Atlético Choloma
